(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club
@sberlogabio
(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club
Коллеги, подскажите, пожалуйста, библиотеки ProDy и/или gemmi умеют адекватно извлекать из mmCIF distance map? Или какая другая библиотека? Или, может, кто встречал готовую заготовку использования ESM2 embeddings + своих дескрипторов для дообучения моделей предсказания distance map/3D структуры белка? Я на kaggle ничего готового не нашёл (плохо искал?)
Я брал у мастера этих дел, может быть у него на гите есть на питоне
https://github.com/sokrypton/map_align
https://github.com/sokrypton/map_align
GitHub
GitHub - sokrypton/map_align: Contact map alignment
Contact map alignment. Contribute to sokrypton/map_align development by creating an account on GitHub.
? 1
Обсуждение 0
Обсуждение не доступно в веб-версии. Чтобы написать комментарий, перейдите в приложение Telegram.
Обсудить в Telegram