Новый стандарт персонализации иммунотерапии меланомы

Ингибиторы иммунных контрольных точек (ИИКТ) стали одним из главных прорывов в лечении метастатической меланомы. Однако у половины пациентов наблюдается первичная резистентность к данной терапии. Ученые ФМБА России доказали: ключ к пониманию механизмов ответа на лечение кроется, в том числе, в сложном составе кишечного микробиома.

👩‍🔬👨🏻‍🔬 Специалисты лаборатории геномных исследований и вычислительной биологии Федерального научно-клинического центра физико-химической медицины им. Ю.М. Лопухина ФМБА России, а также Национального медицинского исследовательского центра онкологии имени Н.Н. Блохина Минздрава России впервые включили российскую когорту пациентов в глобальный кросс-когортный анализ микробиома.

🔬В ходе исследования были проанализированы данные 490 пациентов из семи независимых когорт (Россия, Германия, Испания, Великобритания, Нидерланды, США). Ученые не только подтвердили связь кишечного микробиома с эффективностью иммунотерапии, но и выявили 527 штаммо-специфичных геномных маркеров, предсказывающих ответ на лечение.

✅Ключевые результаты, меняющие представление о микробиомных маркерах:

🔻Штамм важнее вида. Анализ микробиоты только на уровне видов всё чаще признаётся недостаточным, поскольку разные штаммы одного и того же вида могут существенно различаться по своим свойствам.

🧪Например, Faecalibacterium prausnitzii долгое время рассматривали как однозначно благоприятного представителя кишечной микробиоты, обладающего преимущественно противовоспалительным действием. Новые данные показывают: отдельные штаммы ассоциированы с успешной терапией, другие - с резистентностью.

🔻Глобальные и популяционно-специфичные сигнатуры. Часть бактериальных маркеров оказалась универсальной для всех когорт.

🧪Например, Faecalibacterium sp.900539945, Bifidobacterium adolescentis, Phocaeicola vulgatus стабильно сопутствовали положительному ответу. Но наряду с этим в российской когорте были выявлены свои популяционные особенности.

🔻Маркеры резистентности. Неэффективность терапии была ассоциирована, в частности, с наличием Enterobacter ludwigii и ряда других условно-патогенных представителей кишечного микробного сообщества. Их присутствие может свидетельствовать о дисбиотических нарушениях, снижающих противоопухолевый иммунитет.

📈От прогноза к терапевтическим инновациям. Разработанный подход позволяет не только предсказывать ответ на иммунотерапию до её начала, но и, возможно, выявлять особенности кишечной микробиоты, которые могут стать в перспективе мишенями для персонализированной коррекции, повышающей эффективность ИИКТ.

⬆️Уже намечен следующий рубеж — исследование кишечного вирома. Бактериофаги, вирусы инфицирующие бактерии, способны модулировать иммунный ответ, индуцируя Т-клетки, перекрёстно реагирующие с опухолевыми антигенами.

Раскрытие терапевтического потенциала вирома позволит выявить принципиально новые мишени и вывести эффективность иммуноонкологических препаратов на новый уровень.

Работа поддержана грантом Российского научного фонда (№ 23-75-10125) и опубликована в международном журнале Gut Microbes.