А вы знаете что такое «Response element, RE», около гена?
Вот, например, есть белок р53, его знают все, кто работает в биологии. Он активный участник в семействе белков, которые предотвращают онкологию (оно и называется семейство р53 белков). Это один из самых исследованных белков человека). Он активирует разные гены, и общий эффект заключается в запуске репарации ДНК, регулирует клеточный цикл, запускает апоптоз, поддерживает стволовость в стволовых клетках, участвует в развитии организма и ангиогенезе и тд и тп.

Это я к чему? Этот белок должен распознать целевые гены как раз через промотор с RE. А для белков этого семейства (р63, р73) эти RE несколько сходные, поэтому различия в их эффектах будут определяться ещё и эпигенетическим контекстом.

Далеко не у всех генов есть описанные или предсказанные RE. А зачем они нужны, кроме того чтобы разобраться как это всё работает? Через такие RE можно сконструировать биохимические сенсоры с репортёрным геном люциферазы и визуализировать события связывания и транскрипции с этих RE.

Погрузился я в эту тему и могут сказать, что очень мало информации в этой теме.