Разобрался )
После импорта дашбордов в БД superset необходимо приводить в соответствие связь чартов с датасетами по id в значении поля query_context таблицы slices.
Решается выполнением такой SQL команды (если у вас PostgreSQL):

UPDATE slices SET query_context = jsonb_set(query_context::jsonb, '{datasource,id}', (SELECT id FROM TABLES WHERE table_name = datasource_name )::TEXT::jsonb)