(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club
@sberlogabio
(sci)Berloga Bioinformatics, Biology, etc. Club
В mmCIF же хранится структура? Значит, можно однозначно получить distance map (я про X-ray белки). Можно это назвать не "extract" а "compute" - получить, вычислить и т.д.
Если посчитать, то чем угодно, хоть в prody.buildDistanceMatrix http://www.bahargroup.org/prody/manual/reference/measure/measure.html#prody.measure.measure.buildDistMatrix
Хоть любым cdist из torch/scipy/etc.
Хоть любым cdist из torch/scipy/etc.
Обсуждение 0
Обсуждение не доступно в веб-версии. Чтобы написать комментарий, перейдите в приложение Telegram.
Обсудить в Telegram